Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms