Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACANP16112 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACANP16112 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACANP16112 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACANP16112 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms