Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf1P15314 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms