Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms