Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prf1P10820 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms