Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P10404 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P10404 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P10404 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P10404 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P10404 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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