Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms