Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ccl20O89093 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ccl20O89093 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ccl20O89093 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Ccl20O89093 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Ccl20O89093 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Ccl20O89093 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Ccl20O89093 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Ccl20O89093 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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