Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms