Protein–RNA interactions for Protein: O70405

Ulk1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk1O70405 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk1O70405 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ulk1O70405 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk1O70405 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk1O70405 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk1O70405 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ulk1O70405 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ulk1O70405 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk1O70405 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk1O70405 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk1O70405 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk1O70405 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms