Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms