Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms