Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccrl2O35457 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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