Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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