Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps1O08983 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps1O08983 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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