Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms