Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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