Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20825J3QM67 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms