Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms