Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r167G3UW71 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r167G3UW71 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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