Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms