Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2564F6Z9S8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms