Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6F6VAN0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6F6VAN0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms