Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lce6aD3YV94 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lce6aD3YV94 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms