Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms