Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms