Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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