Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
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