Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms