Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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