Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BCANQ96GW7 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BCANQ96GW7 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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