Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FAM3DQ96BQ1 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms