Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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