Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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