Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD42Q8N9B4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD42Q8N9B4 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 479.5 ms