Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KNOP1Q1ED39 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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