Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTF1Q16619 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms