Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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