Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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VAMP3Q15836 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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