Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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