Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHHQ15465 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHHQ15465 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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