Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNC3Q14003 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms