Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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