Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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