Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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FOXE3Q13461 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXE3Q13461 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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