Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
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