Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PMS2P3Q13401 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms