Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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ITGB3BPQ13352 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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ITGB3BPQ13352 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ITGB3BPQ13352 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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ITGB3BPQ13352 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGB3BPQ13352 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGB3BPQ13352 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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