Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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RIGQ13278 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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RIGQ13278 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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RIGQ13278 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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RIGQ13278 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
RIGQ13278 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RIGQ13278 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RIGQ13278 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RIGQ13278 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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