Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms